ノート/テキストマイニング
訪問者数 1048      最終更新 2010-03-24 (水) 14:41:48

以前(08/12/20付)医薬品添付文書DB というリンクをメニューに貼った。

今般、もう少し考えてみることにした。

狙い目

薬剤師や医師などの医療関係者が、医薬品を使う(処方する)ときに、 医薬品情報を「より容易に」チェックできるようにしよう。

「より容易に」の定義は難しい。今後ユーザ(現場のスタッフ)側からの意見を吸い上げたい。
現段階では、技術側からの改良可能な点を考えてみる。

データの材料

まず、以前のリンクで見たような「独立行政法人 医薬品医療機器総合機構(Pharmaceuticals and Medical Devices Agency)」のデータベースがある。

およそ、各製薬企業が提供した(電子化された)添付文書の内容を集めたもの。
Web画面表示のほか、(1つ1つの医薬品ごとではあるが)SGML(DTD)形式のファイルをダウンロードすることができる。

<?EBT: ENCODING shift-jis>
<!DOCTYPE PACKINS SYSTEM "package_insert.dtd"
[
]>

<packins lang="ja" version="2.1"><variablelabel onswitch="on">添付文書</variablelabel>
<packageinsertno><variablelabel onswitch="on">添付文書番号</variablelabel>2790803Q1020_2_01</packageinsertno>
<companyidentifier><variablelabel onswitch="on">製薬会社識別コード</variablelabel>201315</companyidentifier>


<dateofpreparationorrevision><variablelabel onswitch="on">作成又は改訂年月</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<markofrevision><variablelabel>改訂記号</variablelabel>*</markofrevision>
<yearmonth><variablelabel>作成改訂年月</variablelabel>2006年11月改訂</yearmonth>
<version><variablelabel>版数</variablelabel> (第2版、薬事法改正に伴う改訂)</version>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>2</serialno>
<markofrevision><variablelabel>改訂記号</variablelabel></markofrevision>
<yearmonth><variablelabel>作成改訂年月</variablelabel>1999年1月作成</yearmonth>
</dateofpreparationorrevision>
<sccj><variablelabel onswitch="on">日本標準商品分類番号</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<sccjno><variablelabel>日本標準商品分類番号</variablelabel>87279</sccjno>
</sccj>
<sccjetc><variablelabel onswitch="on">日本標準商品分類番号等</variablelabel>
<yrmoofreevaluation><variablelabel onswitch="on">再評価結果公表年月(最新)</variablelabel>1982年8月</yrmoofreevaluation>
</sccjetc>
<therapeuticclassification><variablelabel onswitch="on">薬効分類名</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<detail><variablelabel>薬効分類名称</variablelabel>歯科口腔用剤</detail>
</therapeuticclassification>
<approvaletc><variablelabel onswitch="on">承認等</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<detailbrandname><variablelabel>販売名毎の明細</variablelabel>
<approvalbrandname><variablelabel onswitch="on">販売名</variablelabel><chr><bold>カントップ用8%塩化亜鉛溶液</bold></chr></approvalbrandname>
<brandcode><variablelabel onswitch="on">販売名コード</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<yjcode><variablelabel>YJ(医情研)コード</variablelabel>2790803Q1020</yjcode>
</brandcode>
(途中まで)

これのためのDTDファイルもダウンロード可能である。

その情報を元に、Web画面に表示されるほか、一般に頒布される本になったりCD-ROMになったりしている。手元に借りてきた、(財)日本医薬情報センター(JAPIC)の「医療用医薬品集」では、上記情報がHTML化された内容をCD-ROMに収容して、提供している。

検索機構の材料

次に、これの検索を考える。医薬品医療機器総合機構のWeb検索ページでは、いろいろな検索項目を設けており、基本的にAND検索をする。具体的には、

我々が手持ちの検索の可能性は、(単純な一致以外には)構造的な一致だろう。文構造(係り受け関係)を限定して検索することが可能だろうが、それがどれだけの効果があるかは、今後の実践にかかってくる。

係り受け関係の解析には、フリーのソフトとして、奈良先端のCaboChaと京都のKNPが有名である。Pythonからのインタフェースを予め提供してくれているCaboChaで解析した例を示す。

原文1:

窩洞に溶液を作用させると,亜鉛は通電しない場合,窩洞表面にわずかに浸透している程度であるが,
通電すると亜鉛の象牙質内への浸透は著明となり,象牙細管に沿って歯髄に達するまで深部に移行する。
また,象牙質に導入された亜鉛はカルシウムと置換して,そこに不溶性の亜鉛化合物として沈着し,象牙細管を填塞する

分析結果:

          窩洞に---D
            溶液を-D
      作用させると,---D
                亜鉛は-D
              通電しない-D
                    場合,-----D
                  窩洞表面に---D
                      わずかに-D
                    浸透している-D
                    程度であるが,-D
                          通電すると-----------------------D
                                亜鉛の-D                   |
                            象牙質内への-D                 |
                                    浸透は-----D           |
                                          著-D |           |
                                          明と-D           |
                                          なり,-------D   |
                                        象牙細管に-D   |   |
                                              沿って---D   |
                                                歯髄に-D   |
                                              達するまで---D
                                                    深部に-D
                                                  移行する。-------------------------D
                                                        また,-----------------------D
                                                        象牙質に-D                   |
                                                        導入された-D                 |
                                                              亜鉛は-----------------D
                                                          カルシウムと-D             |
                                                              置換して,-------D     |
                                                                    そこに-----D     |
                                                                    不溶性の-D |     |
                                                              亜鉛化合物として-D     |
                                                                        沈着し,---D |
                                                                        象牙細管を-D |
                                                                                  填-D
                                                                                塞する
EOS


* 0 2D 0/1 1.426286
窩洞    名詞,一般,*,*,*,*,*     O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 1 2D 0/1 1.388611
溶液    名詞,一般,*,*,*,*,溶液,ヨウエキ,ヨーエキ        O
を      助詞,格助詞,一般,*,*,*,を,ヲ,ヲ O
* 2 4D 1/3 0.052055
作用    名詞,サ変接続,*,*,*,*,作用,サヨウ,サヨー        O
さ      動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然レル接続,する,サ,サ        O
せる    動詞,接尾,*,*,一段,基本形,せる,セル,セル        O
と      助詞,接続助詞,*,*,*,*,と,ト,ト  O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 3 4D 0/1 0.831576
亜鉛    名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン    O
は      助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ    O
* 4 5D 1/2 1.018153
通電    名詞,サ変接続,*,*,*,*,通電,ツウデン,ツーデン    O
し      動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然形,する,シ,シ      O
ない    助動詞,*,*,*,特殊・ナイ,基本形,ない,ナイ,ナイ   O
* 5 8D 0/0 1.048844
場合    名詞,副詞可能,*,*,*,*,場合,バアイ,バアイ        O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 6 8D 1/2 1.361422
窩洞    名詞,一般,*,*,*,*,*     O
表面    名詞,一般,*,*,*,*,表面,ヒョウメン,ヒョーメン    O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 7 8D 0/1 2.190626
わずか  副詞,助詞類接続,*,*,*,*,わずか,ワズカ,ワズカ    O
に      助詞,副詞化,*,*,*,*,に,ニ,ニ    O
* 8 9D 1/3 2.363379
浸透    名詞,サ変接続,*,*,*,*,浸透,シントウ,シントー    O
し      動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ      O
て      助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ  O
いる    動詞,非自立,*,*,一段,基本形,いる,イル,イル      O
* 9 10D 0/3 0.163756
程度    名詞,一般,*,*,*,*,程度,テイド,テイド    O
で      助動詞,*,*,*,特殊・ダ,連用形,だ,デ,デ   O
ある    助動詞,*,*,*,五段・ラ行アル,基本形,ある,アル,アル       O
が      助詞,接続助詞,*,*,*,*,が,ガ,ガ  O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 10 22D 1/2 1.072063
通電    名詞,サ変接続,*,*,*,*,通電,ツウデン,ツーデン    O
する    動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル  O
と      助詞,接続助詞,*,*,*,*,と,ト,ト  O
* 11 12D 0/1 0.868923
亜鉛    名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン    O
の      助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ    O
* 12 13D 2/4 1.700219
象牙    名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ    O
質      名詞,一般,*,*,*,*,質,シツ,シツ  O
内      名詞,接尾,一般,*,*,*,内,ナイ,ナイ       O
へ      助詞,格助詞,一般,*,*,*,へ,ヘ,エ O
の      助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ    O
* 13 16D 0/1 0.184359
浸透    名詞,サ変接続,*,*,*,*,浸透,シントウ,シントー    O
は      助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ    O
* 14 15D 0/0 0.313452
著      形容詞,自立,*,*,形容詞・アウオ段,ガル接続,著い,シル,シル        O
* 15 16D 0/1 1.867631
明      名詞,固有名詞,人名,名,*,*,明,アキラ,アキラ      O
と      助詞,格助詞,一般,*,*,*,と,ト,ト O
* 16 20D 0/0 0.321806
なり    動詞,自立,*,*,五段・ラ行,連用形,なる,ナリ,ナリ  O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 17 18D 1/2 1.198726
象牙    名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ    O
細管    名詞,一般,*,*,*,*,細管,サイカン,サイカン        O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 18 20D 0/1 0.388663
沿っ    動詞,自立,*,*,五段・ワ行促音便,連用タ接続,沿う,ソッ,ソッ        O
て      助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ  O
* 19 20D 0/1 1.648252
歯髄    名詞,一般,*,*,*,*,歯髄,シズイ,シズイ    O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 20 22D 0/1 3.696688
達する  動詞,自立,*,*,サ変・−スル,基本形,達する,タッスル,タッスル      O
まで    助詞,副助詞,*,*,*,*,まで,マデ,マデ      O
* 21 22D 0/1 3.320836
深部    名詞,一般,*,*,*,*,深部,シンブ,シンブ    O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 22 35D 1/1 0.000000
移行    名詞,サ変接続,*,*,*,*,移行,イコウ,イコー        O
する    動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル  O
。      記号,句点,*,*,*,*,。,。,。      O
* 23 35D 0/0 0.000000
また    接続詞,*,*,*,*,*,また,マタ,マタ O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 24 25D 1/2 1.680220
象牙    名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ    O
質      名詞,接尾,一般,*,*,*,質,シツ,シツ       O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 25 26D 1/3 1.598255
導入    名詞,サ変接続,*,*,*,*,導入,ドウニュウ,ドーニュー        O
さ      動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然レル接続,する,サ,サ        O
れ      動詞,接尾,*,*,一段,連用形,れる,レ,レ    O
た      助動詞,*,*,*,特殊・タ,基本形,た,タ,タ   O
* 26 35D 0/1 0.000000
亜鉛    名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン    O
は      助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ    O
* 27 28D 0/1 2.519112
カルシウム      名詞,一般,*,*,*,*,カルシウム,カルシウム,カルシウム      O
と      助詞,格助詞,一般,*,*,*,と,ト,ト O
* 28 32D 1/2 0.460756
置換    名詞,サ変接続,*,*,*,*,置換,チカン,チカン        O
し      動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ      O
て      助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ  O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 29 32D 0/1 1.011573
そこ    名詞,代名詞,一般,*,*,*,そこ,ソコ,ソコ   O
に      助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 30 31D 0/1 1.154547
不溶性  名詞,一般,*,*,*,*,不溶性,フヨウセイ,フヨーセイ  O
の      助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ    O
* 31 32D 2/3 1.023025
亜鉛    名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン    O
化合    名詞,サ変接続,*,*,*,*,化合,カゴウ,カゴー        O
物      名詞,接尾,一般,*,*,*,物,ブツ,ブツ       O
として  助詞,格助詞,連語,*,*,*,として,トシテ,トシテ     O
* 32 34D 1/1 0.066189
沈着    名詞,サ変接続,*,*,*,*,沈着,チンチャク,チンチャク        O
し      動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ      O
,      記号,読点,*,*,*,*,,,,,,      O
* 33 34D 1/2 0.030409
象牙    名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ    O
細管    名詞,一般,*,*,*,*,細管,サイカン,サイカン        O
を      助詞,格助詞,一般,*,*,*,を,ヲ,ヲ O
* 34 35D 0/0 0.000000
填      動詞,自立,*,*,五段・ラ行,体言接続特殊2,填る,ハマ,ハマ  O
* 35 -1D 1/1 0.000000
塞      名詞,一般,*,*,*,*,*     O
する    動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル  O
EOS

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Last-modified: 2010-03-24 (水) 14:41:48 (2704d)