山内の授業のページ
アクセス数 1798  このページの最終更新 2008-12-16 (火) 09:26:42

12/19(金)は計算機演習を行うので、3号館1階計算機室に集合してください

2008年秋学期 情報科学講究II バイオインフォマティクス入門

金曜日 2限

授業の目的

このクラスでは、情報科学の眼から見たバイオインフォマティクス(生命科学への情報科学・情報処理の応用)を概観し、およそどのような分野であるか、またどのような情報科学・技術が求められてきたのか、を理解する。その最終目的は、情報技術者としての応用分野との関わり方を、生命科学を例題分野として、掴み取ることである。

前提知識

授業の進め方・評価・教科書などについて

教科書:特に指定しない
参考書:「バイオインフォマティクス基礎講義」A.M.Lesk、岡崎康司他訳、MEDSi 4-89592-343-6
「バイオインフォマティクス入門」J.C.Setubal他、五条堀孝他訳、共立出版 4-320-05580-2
その他、授業中に必要に応じて紹介する。

評価
中間レポート(3回、各20点、計60点)、期末レポート(40点)の合計点を評価とする。

オフィス・アワー
山内:月曜日3・5限、火曜日4・5限(4541教室)(実験・会議のない週に限る、予定表を参照のこと)
吉田:月曜日16:20〜17:00、水曜日14:40〜17:00、金曜日14:40〜17:00(4641教室)

授業スケジュール

シラバスから若干の変更があるので注意。

テーマ内容資料
19/19バイオインフォマティクス(分子)生物学の概観、情報処理とのかかわりfilebif08_1.pdf filebif07_ref.pdf
29/26ゲノムとデータベースゲノム解析へのコンピュータやネットの貢献filebif08_2.pdf
310/03配列(1)(吉田先生)相同性の分析
410/10配列(2)(吉田先生)ダイナミックプログラミング
510/17生物分類と配列距離とクラスタ分析filebif08_5.pdf filehighschool08.pdf
610/24計算機演習1配列解析・CLUSTAL-W演習filebif08_6_enshuu.doc   filebif08_6_enshuu.pdf   filehemoglobin_fasta.txt filemyoglobin_fasta.txt filelysozyme_fasta.txt  ノート/分子進化学
710/31タンパク質の構造と機能構造の分類、機能との関連、構造決定/推定技術概論&ref(): File not found: "bif07_7.pdf" at page "山内の授業のページ/08秋/講究2"; &ref(): File not found: "bif07_7.ppt" at page "山内の授業のページ/08秋/講究2";
811/14タンパク質の構造と機能構造推定技術、動力学的分子モデル、ヒューリスティックな分析&ref(): File not found: "bif07_8.pdf" at page "山内の授業のページ/08秋/講究2";&ref(): File not found: "bif07_8.ppt" at page "山内の授業のページ/08秋/講究2";
911/21構造分析演習 創薬と情報科学&ref(): File not found: "bif07_9_enshuu2.pdf" at page "山内の授業のページ/08秋/講究2";
1011/28創薬と情報科学 遺伝子多型(SNP)とテーラーメード医療
1112/05遺伝子多型(SNP)とテーラーメード医療 パスウェイ情報と生物シミュレーション
1212/12パスウェイ情報と生物シミュレーション 文献情報とテキストマイニング
1312/19文献情報とテキストマイニング 計算機演習2 タンパクの構造filebif08_13_enshuu2.doc   filebif08_13_enshuu2.pdf
1401/09演習(未定)

添付ファイル: filebif08_13_enshuu2.pdf 705件 [詳細] filebif08_13_enshuu2.doc 1654件 [詳細] filebif08_6_enshuu.pdf 595件 [詳細] filebif07_ref.pdf 534件 [詳細] filehighschool08.pdf 588件 [詳細] filebif08_5.pdf 660件 [詳細] filebif08_2.pdf 689件 [詳細] filebif08_1.pdf 630件 [詳細] filebif08_6_enshuu.doc 815件 [詳細] filelysozyme_fasta.txt 716件 [詳細] filemyoglobin_fasta.txt 655件 [詳細] filehemoglobin_fasta.txt 682件 [詳細]

トップ   編集 凍結 差分 バックアップ 添付 複製 名前変更 リロード   新規 一覧 単語検索 最終更新   ヘルプ   最終更新のRSS
Last-modified: 2008-12-16 (火) 09:26:42 (3140d)