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アクセス数 1466  このページの最終更新 2010-06-28 (月) 16:47:19

2010年春学期 バイオインフォマティクス基礎論

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  期末レポートについて ==>  file期末課題 を参照
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火曜日 4限  (注)昨年度まで秋学期開講だったが、2010年度から春学期開講となった。

授業の目的

「バイオ」(生物学・生命科学)を適用の中心分野としたときの、「インフォマティクス」(情報学 〜 大量のデータから意味ある情報を知的処理によって抽出)のさまざまな手法・原理を学ぶ。

前提知識

授業スケジュール(as of 2010/03/10)

テーマ内容教科書
104/06バイオインフォマティクス総論(分子)生物学の概観、情報処理第1章
204/13配列アラインメント(1)?ペアワイズアラインメント・ローカルアラインメント2.1〜2.4
304/20配列アラインメント(2)?ホモロジー検索・マルチプルアラインメント2.5〜2.6
404/27配列解析(1)?モチーフ・HMM・カーネル法3.1〜3.3
505/11配列解析(2)?ゲノム配列推定・ゲノム再構成 3.4〜3.5
605/18進化系統樹推定(1)?系統樹・距離行列法4.1〜4.3
705/25進化系統樹推定(2)?最節約法・進化の確率モデル・評価と比較4.4〜4.6
806/01高次構造解析・比較RNA2次構造予測・構造比較5.1〜5.2
906/08高次構造推定    タンパク質立体構造予測5.3
1006/15ネットワーク解析(1)遺伝子発現解析・遺伝子ネットワーク6.1〜6.2
1106/22ネットワーク解析(2)タンパク相互作用推定・ネットワーク構造解析6.3〜6.4
1206/29文献情報とテキストマイニング(1)
1307/06文献情報とテキストマイニング(2)
1407/13(未定)

授業の進め方・評価・教科書などについて

授業の進め方:

教科書:

参考書: いずれも、図書館にある。その他、授業中に必要に応じて紹介する。

評価

オフィス・アワー

  メモ: 清水謙多郎先生の資料

メモ: JSTバイオインフォマティクス推進センターゲノム解析ツール リンク集

第7回進化系統樹(2)演習課題のための資料とデータ例


添付ファイル: file期末課題.pdf 435件 [詳細] filebif10_7_enshuu.pdf 883件 [詳細]

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Last-modified: 2010-06-28 (月) 16:47:19 (2580d)