山内の授業のページ/18秋/生物分子・情報科学概論の変更点

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**18年度秋学期　生物分子・情報科学概論 [#y776e1e1]
水曜日２限~

***１．　授業内容 [#p11f44cd]
「情報処理とは何か」を理解したい。　

コンピュータを利用するために、また、データの処理などでプログラムを書かなければならない時のために、分かっておくとよさそうなことを紹介する。

プログラムを書くというプロセスの、全体イメージを何となくつかんで欲しい。　いざとなったときに、プログラミングに取り付くための道筋、何が必要かを理解し、どうすれば取り付けそうかを感覚としてつかんで欲しい。

このクラスでは、プログラムがスイスイ書けることが目標ではありません。　プログラムってどんなもの？　作らなくてはいけない時に、何を知ればいいの？　何を考えればいいの？　といったイメージを自分の中に持って欲しい。

⇒　そうすれば、いざプログラムが必要となった時に自分で勉強できる。（必要になった時に本格的に勉強すればよい）


***2．　教科書など [#x6909c66]
教科書は指定しません。授業中に資料を配布します。~
参考書は多数出ています。

***４．　授業の進め方 [#f93a2659]
実習を含めた授業をします。

***５．　評価 [#jd48af7f]
授業中の学習態度30%　＋　授業内の小レポート課題30%　＋　最終レポート40%

***６．　オフィスアワーなど [#r17ca180]
　山内へのコンタクト：　メール：yamanouc at is.sci.toho-u.ac.jp　（at⇒@に書き直す）~
　オフィスアワー：　２号館２階２２１２室（教育開発センター事務室）、非常勤（月・水・木に出校の予定）

***授業予定（as of 2018/09/15） [#xbe4075f]
| |日程|テーマ                    |内容                                  |配布資料|
|1|9/26|授業概要・基本的な考え方  |授業の説明、授業の環境、プログラムの考え方|&ref(mb1-1.pdf,,授業概要); &ref(sec1-1.pdf,,スライド);|
|2|10/3|プログラムとは（イメージ）|PCの概略、簡単なプログラムを考えてみる、試してみる| &ref(sec2-1.pdf,,スライド);|
|3|10/10|プログラムの基本的な考え方|プログラム実行の仕組、構造、値・変数・代入、条件分岐と繰り返し|&ref(sec3-1.pdf,,スライド); |
|4|10/17|考え方（続）、ライブラリ  |ライブラリとは、使い方、よく使うライブラリと使用例|&ref(sec4-1.pdf,,スライド); |
|5|10/24|データを処理してみる１     |リストとループで数値をいじる（総和、平均）|&ref(sec5-1.pdf,,スライド); &ref(sanmoku2.ipynb); |
|6|10/31|自分で考えてみよう１      |最大・最小値、ソートなど|&ref(sec6-1.pdf,,スライド); |
|7|11/7|データを処理してみる２    |文字をいじる（文字を数える、文字列の操作）、文字ファイル読み書き|&ref(sec7-1.pdf,,スライド);  |
|8|11/14|自分で考えてみよう２      |%%英文文字頻度%%、配列の塩基比率、コドン抽出|&ref(sec8-1.pdf,,スライド); &ref(mb-8.zip);|
|9|11/21|データを処理してみる３    |英文文字頻度、日本語文の単語頻度、　%%描画ライブラリでヒストグラム・散布図を描く%%|&ref(sec9-1.pdf,,スライド); &ref(mb-9.zip);|
|10|11/28|自分で考えてみよう３      |配列アラインメントと系統樹、%%文字頻度のヒストグラム、アイスクリーム支出の散布図%%|&ref(sec10-1.pdf,,スライド); &ref(mb-10.zip); |
|11|12/5|データを処理してみる４    |%%numpy行列、pandasデータフレームの処理%% 統計への招待|&ref(sec11-1.pdf,,スライド);  |
|12|12/12|自分で考えてみよう４      |%%（演習例題模索中）%% 統計への招待・実技編|&ref(sec12-1.pdf,,スライド); |
|13|12/19|データを処理してみる５    |BioPython| |
|13|12/19|データを処理してみる５    |%%BioPython%% バイオインフォマティクスの側面|&ref(sec13-1.pdf,,スライド);  |
|14|1/6|いろいろな応用|| |
|15||まとめ・質問|| |
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