山内の授業のページ/19秋/生物分子・情報科学概論の変更点

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**19年度秋学期　生物分子・情報科学概論 [#fb25eba6]
水曜日２限~

***１．　授業内容 [#r1c6e3f5]
「情報処理とは何か」を理解したい。　

コンピュータを利用するために、また、データの処理などでプログラムを書かなければならない時のために、分かっておくとよさそうなことを紹介する。

プログラムを書くというプロセスの、全体イメージを何となくつかんで欲しい。　いざとなったときに、プログラミングに取り付くための道筋、何が必要かを理解し、どうすれば取り付けそうかを感覚としてつかんで欲しい。

このクラスでは、プログラムがスイスイ書けることが目標ではありません。　プログラムってどんなもの？　作らなくてはいけない時に、何を知ればいいの？　何を考えればいいの？　といったイメージを自分の中に持って欲しい。

⇒　そうすれば、いざプログラムが必要となった時に自分で勉強できる。（必要になった時に本格的に勉強すればよい）


***2．　教科書など [#p1c885f3]
//教科書は指定しません。授業中に資料を配布します。~
//参考書は多数出ています。
未定

***４．　授業の進め方 [#j673d26a]
実習を含めた授業をします。

***５．　評価 [#xfe35d97]
授業中の学習態度30%　＋　授業内の小レポート課題30%　＋　最終レポート40%

***６．　オフィスアワーなど [#ob221490]
　山内へのコンタクト：　メール：yamanouc at is.sci.toho-u.ac.jp　（at⇒@に書き直す）~
　オフィスアワー：　教育開発センター事務室（5号館5階）、非常勤（月・水に出校）

***授業予定（as of 2018/09/15） [#dd57514a]
下記は今後大きな変更ある予定。日程も未修正。

| |日程|テーマ                    |内容                                  |配布資料|
|1|9/25|授業概要・基本的な考え方  |授業の説明、授業の環境、とりあえず…|&ref(mb1-1.pdf,,授業概要); &ref(sec1-1.pdf,,スライド);|
|2|10/2|いいから試してみよっと|PCの概略、簡単なプログラムを試してみる| &ref(sec2-1.pdf,,スライド);|
|3|10/09|試した中身を見てみる||&ref(sec3-1.pdf,,スライド); |
|4|10/16|考え方（続）、ライブラリ  |ライブラリとは、使い方、よく使うライブラリと使用例|&ref(sec4-1.pdf,,スライド); |
|3|10/09|試した中身を見てみる|自分で少しだけ変えてみよう|&ref(sec3-1.pdf,,スライド); |
|4|10/16|使える道具 |ベースとライブラリ、ベースの基本、よく使うライブラリ|&ref(sec4-1.pdf,,スライド); |
|5|10/23|データを処理してみる１     |リストとループで数値をいじる（総和、平均）|&ref(sec5-1.pdf,,スライド); &ref(sanmoku2.ipynb); |
|6|10/30|自分で考えてみよう１      |最大・最小値、ソートなど|&ref(sec6-1.pdf,,スライド); |
|7|11/06|データを処理してみる２    |文字をいじる（文字を数える、文字列の操作）、文字ファイル読み書き|&ref(sec7-1.pdf,,スライド);  |
|8|11/13|自分で考えてみよう２      |%%英文文字頻度%%、配列の塩基比率、コドン抽出|&ref(sec8-1.pdf,,スライド); &ref(mb-8.zip);|
|9|11/20|データを処理してみる３    |英文文字頻度、日本語文の単語頻度、　%%描画ライブラリでヒストグラム・散布図を描く%%|&ref(sec9-1.pdf,,スライド); &ref(mb-9.zip);|
|10|11/27|自分で考えてみよう３      |配列アラインメントと系統樹、%%文字頻度のヒストグラム、アイスクリーム支出の散布図%%|&ref(sec10-1.pdf,,スライド); &ref(mb-10.zip); |
|11|12/4|データを処理してみる４    |%%numpy行列、pandasデータフレームの処理%% 統計への招待|&ref(sec11-1.pdf,,スライド);  |
|12|12/11|自分で考えてみよう４      |%%（演習例題模索中）%% 統計への招待・実技編|&ref(sec12-1.pdf,,スライド); |
|13|12/18|データを処理してみる５    |%%BioPython%% バイオインフォマティクスの側面|&ref(sec13-1.pdf,,スライド);  |
|14|12/25|いろいろな応用|| |
|15||まとめ・質問|| |
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