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ノート/解析支援_2017-01-15https://pepper.is.sci.toho-u.ac.jp:443/pepper/index.php?%A5%CE%A1%BC%A5%C8%2F%B2%F2%C0%CF%BB%D9%B1%E7_2017-01-15 |
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ノート/ノート
1384 2017-01-29 (日) 16:42:51
参考
本家は
変異・多型検出? GATKの一部らしい
snpEffとは、SNVやIndelなどの変異にアノテーション付けをしてくれるソフトの事です。
全308件をチェック、そのうち18件にOptimal Temperature記述あり。ほとんど役立たず?
全210件をチェック、そのうち8件にOptimum Temperature記述あり。
全42件をチェック、そのうち2件にOptimum Temperature記述あり。
全135件をチェック、そのうち19件にOptimum Temperature記述あり。
Genome Referenceのページ から Escherichia coli
全部で5400件のうち、先頭の200件だけチェック。そのうち20件にOptimum Temperature記述あり。ほとんど37C。
16S rRNA系統解析