山内の授業のページ/18秋/生物分子・情報科学概論

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アクセス数　1095　　このページの最終更新　2018-12-15 (土) 16:48:41

18年度秋学期　生物分子・情報科学概論 †

水曜日２限

１．　授業内容 †

「情報処理とは何か」を理解したい。　

コンピュータを利用するために、また、データの処理などでプログラムを書かなければならない時のために、分かっておくとよさそうなことを紹介する。

プログラムを書くというプロセスの、全体イメージを何となくつかんで欲しい。　いざとなったときに、プログラミングに取り付くための道筋、何が必要かを理解し、どうすれば取り付けそうかを感覚としてつかんで欲しい。

このクラスでは、プログラムがスイスイ書けることが目標ではありません。　プログラムってどんなもの？　作らなくてはいけない時に、何を知ればいいの？　何を考えればいいの？　といったイメージを自分の中に持って欲しい。

⇒　そうすれば、いざプログラムが必要となった時に自分で勉強できる。（必要になった時に本格的に勉強すればよい）

2．　教科書など †

教科書は指定しません。授業中に資料を配布します。
参考書は多数出ています。

４．　授業の進め方 †

実習を含めた授業をします。

５．　評価 †

授業中の学習態度30%　＋　授業内の小レポート課題30%　＋　最終レポート40%

６．　オフィスアワーなど †

　山内へのコンタクト：　メール：yamanouc at is.sci.toho-u.ac.jp　（at⇒@に書き直す）
　オフィスアワー：　２号館２階２２１２室（教育開発センター事務室）、非常勤（月・水・木に出校の予定）

授業予定（as of 2018/09/15） †

	日程	テーマ	内容	配布資料
1	9/26	授業概要・基本的な考え方	授業の説明、授業の環境、プログラムの考え方	授業概要 スライド
2	10/3	プログラムとは（イメージ）	PCの概略、簡単なプログラムを考えてみる、試してみる	スライド
3	10/10	プログラムの基本的な考え方	プログラム実行の仕組、構造、値・変数・代入、条件分岐と繰り返し	スライド
4	10/17	考え方（続）、ライブラリ	ライブラリとは、使い方、よく使うライブラリと使用例	スライド
5	10/24	データを処理してみる１	リストとループで数値をいじる（総和、平均）	スライド sanmoku2.ipynb
6	10/31	自分で考えてみよう１	最大・最小値、ソートなど	スライド
7	11/7	データを処理してみる２	文字をいじる（文字を数える、文字列の操作）、文字ファイル読み書き	スライド
8	11/14	自分で考えてみよう２	英文文字頻度、配列の塩基比率、コドン抽出	スライド mb-8.zip
9	11/21	データを処理してみる３	英文文字頻度、日本語文の単語頻度、　描画ライブラリでヒストグラム・散布図を描く	スライド mb-9.zip
10	11/28	自分で考えてみよう３	配列アラインメントと系統樹、文字頻度のヒストグラム、アイスクリーム支出の散布図	スライド mb-10.zip
11	12/5	データを処理してみる４	numpy行列、pandasデータフレームの処理 統計への招待	スライド
12	12/12	自分で考えてみよう４	（演習例題模索中） 統計への招待・実技編	スライド
13	12/19	データを処理してみる５	BioPython バイオインフォマティクスの側面	スライド
14	1/6	いろいろな応用
15		まとめ・質問