[[ノート/テキストマイニング]]~
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以前（08/12/20付）[[医薬品添付文書ＤＢ:http://www.info.pmda.go.jp/psearch/html/menu_tenpu_base.html]] というリンクをメニューに貼った。
今般、もう少し考えてみることにした。
***狙い目 [#ucf174e1]
薬剤師や医師などの医療関係者が、医薬品を使う（処方する）ときに、
医薬品情報を「より容易に」チェックできるようにしよう。
「より容易に」の定義は難しい。今後ユーザ（現場のスタッフ）側からの意見を吸い上げたい。~
現段階では、技術側からの改良可能な点を考えてみる。
***データの材料 [#i0b7f52d]
まず、以前のリンクで見たような「独立行政法人 医薬品医療機器総合機構（Pharmaceuticals and Medical Devices Agency）」のデータベースがある。
>およそ、各製薬企業が提供した（電子化された）添付文書の内容を集めたもの。~
Web画面表示のほか、（１つ１つの医薬品ごとではあるが）SGML（DTD）形式のファイルをダウンロードすることができる。
<?EBT: ENCODING shift-jis>
<!DOCTYPE PACKINS SYSTEM "package_insert.dtd"
[
]>
<packins lang="ja" version="2.1"><variablelabel onswitch="on">添付文書</variablelabel>
<packageinsertno><variablelabel onswitch="on">添付文書番号</variablelabel>2790803Q1020_2_01</packageinsertno>
<companyidentifier><variablelabel onswitch="on">製薬会社識別コード</variablelabel>201315</companyidentifier>
<dateofpreparationorrevision><variablelabel onswitch="on">作成又は改訂年月</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<markofrevision><variablelabel>改訂記号</variablelabel>*</markofrevision>
<yearmonth><variablelabel>作成改訂年月</variablelabel>2006年11月改訂</yearmonth>
<version><variablelabel>版数</variablelabel> (第2版、薬事法改正に伴う改訂)</version>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>2</serialno>
<markofrevision><variablelabel>改訂記号</variablelabel></markofrevision>
<yearmonth><variablelabel>作成改訂年月</variablelabel>1999年1月作成</yearmonth>
</dateofpreparationorrevision>
<sccj><variablelabel onswitch="on">日本標準商品分類番号</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<sccjno><variablelabel>日本標準商品分類番号</variablelabel>87279</sccjno>
</sccj>
<sccjetc><variablelabel onswitch="on">日本標準商品分類番号等</variablelabel>
<yrmoofreevaluation><variablelabel onswitch="on">再評価結果公表年月（最新）</variablelabel>1982年8月</yrmoofreevaluation>
</sccjetc>
<therapeuticclassification><variablelabel onswitch="on">薬効分類名</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<detail><variablelabel>薬効分類名称</variablelabel>歯科口腔用剤</detail>
</therapeuticclassification>
<approvaletc><variablelabel onswitch="on">承認等</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<detailbrandname><variablelabel>販売名毎の明細</variablelabel>
<approvalbrandname><variablelabel onswitch="on">販売名</variablelabel><chr><bold>カントップ用８％塩化亜鉛溶液</bold></chr></approvalbrandname>
<brandcode><variablelabel onswitch="on">販売名コード</variablelabel>
<serialno onoff="off"><variablelabel>順序番号</variablelabel>1</serialno>
<yjcode><variablelabel>ＹＪ（医情研）コード</variablelabel>2790803Q1020</yjcode>
</brandcode>
（途中まで）
>これのためのDTDファイルもダウンロード可能である。
>その情報を元に、Web画面に表示されるほか、一般に頒布される本になったりCD-ROMになったりしている。手元に借りてきた、（財）日本医薬情報センター（JAPIC）の「医療用医薬品集」では、上記情報がHTML化された内容をCD-ROMに収容して、提供している。
***検索機構の材料 [#z941dfc5]
次に、これの検索を考える。医薬品医療機器総合機構のWeb検索ページでは、いろいろな検索項目を設けており、基本的にAND検索をする。具体的には、
-一般名・販売名
-薬効分類（選択肢）
-項目内検索１〜３ （AND/OR/NOTでの検索）
-以下の項目のあるものを検索（警告・禁忌・相互作用・慎重投与）
我々が手持ちの検索の可能性は、（単純な一致以外には）構造的な一致だろう。文構造（係り受け関係）を限定して検索することが可能だろうが、それがどれだけの効果があるかは、今後の実践にかかってくる。
係り受け関係の解析には、フリーのソフトとして、奈良先端のCaboChaと京都のKNPが有名である。Pythonからのインタフェースを予め提供してくれているCaboChaで解析した例を示す。
原文１：
窩洞に溶液を作用させると，亜鉛は通電しない場合，窩洞表面にわずかに浸透している程度であるが，
通電すると亜鉛の象牙質内への浸透は著明となり，象牙細管に沿って歯髄に達するまで深部に移行する。
また，象牙質に導入された亜鉛はカルシウムと置換して，そこに不溶性の亜鉛化合物として沈着し，象牙細管を填塞する
分析結果：
窩洞に---D
溶液を-D
作用させると，---D
亜鉛は-D
通電しない-D
場合，-----D
窩洞表面に---D
わずかに-D
浸透している-D
程度であるが，-D
通電すると-----------------------D
亜鉛の-D |
象牙質内への-D |
浸透は-----D |
著-D | |
明と-D |
なり，-------D |
象牙細管に-D | |
沿って---D |
歯髄に-D |
達するまで---D
深部に-D
移行する。-------------------------D
また，-----------------------D
象牙質に-D |
導入された-D |
亜鉛は-----------------D
カルシウムと-D |
置換して，-------D |
そこに-----D |
不溶性の-D | |
亜鉛化合物として-D |
沈着し，---D |
象牙細管を-D |
填-D
塞する
EOS
* 0 2D 0/1 1.426286
窩洞 名詞,一般,*,*,*,*,* O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 1 2D 0/1 1.388611
溶液 名詞,一般,*,*,*,*,溶液,ヨウエキ,ヨーエキ O
を 助詞,格助詞,一般,*,*,*,を,ヲ,ヲ O
* 2 4D 1/3 0.052055
作用 名詞,サ変接続,*,*,*,*,作用,サヨウ,サヨー O
さ 動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然レル接続,する,サ,サ O
せる 動詞,接尾,*,*,一段,基本形,せる,セル,セル O
と 助詞,接続助詞,*,*,*,*,と,ト,ト O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 3 4D 0/1 0.831576
亜鉛 名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン O
は 助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ O
* 4 5D 1/2 1.018153
通電 名詞,サ変接続,*,*,*,*,通電,ツウデン,ツーデン O
し 動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然形,する,シ,シ O
ない 助動詞,*,*,*,特殊・ナイ,基本形,ない,ナイ,ナイ O
* 5 8D 0/0 1.048844
場合 名詞,副詞可能,*,*,*,*,場合,バアイ,バアイ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 6 8D 1/2 1.361422
窩洞 名詞,一般,*,*,*,*,* O
表面 名詞,一般,*,*,*,*,表面,ヒョウメン,ヒョーメン O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 7 8D 0/1 2.190626
わずか 副詞,助詞類接続,*,*,*,*,わずか,ワズカ,ワズカ O
に 助詞,副詞化,*,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 8 9D 1/3 2.363379
浸透 名詞,サ変接続,*,*,*,*,浸透,シントウ,シントー O
し 動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ O
て 助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ O
いる 動詞,非自立,*,*,一段,基本形,いる,イル,イル O
* 9 10D 0/3 0.163756
程度 名詞,一般,*,*,*,*,程度,テイド,テイド O
で 助動詞,*,*,*,特殊・ダ,連用形,だ,デ,デ O
ある 助動詞,*,*,*,五段・ラ行アル,基本形,ある,アル,アル O
が 助詞,接続助詞,*,*,*,*,が,ガ,ガ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 10 22D 1/2 1.072063
通電 名詞,サ変接続,*,*,*,*,通電,ツウデン,ツーデン O
する 動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル O
と 助詞,接続助詞,*,*,*,*,と,ト,ト O
* 11 12D 0/1 0.868923
亜鉛 名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン O
の 助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ O
* 12 13D 2/4 1.700219
象牙 名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ O
質 名詞,一般,*,*,*,*,質,シツ,シツ O
内 名詞,接尾,一般,*,*,*,内,ナイ,ナイ O
へ 助詞,格助詞,一般,*,*,*,へ,ヘ,エ O
の 助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ O
* 13 16D 0/1 0.184359
浸透 名詞,サ変接続,*,*,*,*,浸透,シントウ,シントー O
は 助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ O
* 14 15D 0/0 0.313452
著 形容詞,自立,*,*,形容詞・アウオ段,ガル接続,著い,シル,シル O
* 15 16D 0/1 1.867631
明 名詞,固有名詞,人名,名,*,*,明,アキラ,アキラ O
と 助詞,格助詞,一般,*,*,*,と,ト,ト O
* 16 20D 0/0 0.321806
なり 動詞,自立,*,*,五段・ラ行,連用形,なる,ナリ,ナリ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 17 18D 1/2 1.198726
象牙 名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ O
細管 名詞,一般,*,*,*,*,細管,サイカン,サイカン O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 18 20D 0/1 0.388663
沿っ 動詞,自立,*,*,五段・ワ行促音便,連用タ接続,沿う,ソッ,ソッ O
て 助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ O
* 19 20D 0/1 1.648252
歯髄 名詞,一般,*,*,*,*,歯髄,シズイ,シズイ O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 20 22D 0/1 3.696688
達する 動詞,自立,*,*,サ変・−スル,基本形,達する,タッスル,タッスル O
まで 助詞,副助詞,*,*,*,*,まで,マデ,マデ O
* 21 22D 0/1 3.320836
深部 名詞,一般,*,*,*,*,深部,シンブ,シンブ O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 22 35D 1/1 0.000000
移行 名詞,サ変接続,*,*,*,*,移行,イコウ,イコー O
する 動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル O
。 記号,句点,*,*,*,*,。,。,。 O
* 23 35D 0/0 0.000000
また 接続詞,*,*,*,*,*,また,マタ,マタ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 24 25D 1/2 1.680220
象牙 名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ O
質 名詞,接尾,一般,*,*,*,質,シツ,シツ O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 25 26D 1/3 1.598255
導入 名詞,サ変接続,*,*,*,*,導入,ドウニュウ,ドーニュー O
さ 動詞,自立,*,*,サ変・スル,未然レル接続,する,サ,サ O
れ 動詞,接尾,*,*,一段,連用形,れる,レ,レ O
た 助動詞,*,*,*,特殊・タ,基本形,た,タ,タ O
* 26 35D 0/1 0.000000
亜鉛 名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン O
は 助詞,係助詞,*,*,*,*,は,ハ,ワ O
* 27 28D 0/1 2.519112
カルシウム 名詞,一般,*,*,*,*,カルシウム,カルシウム,カルシウム O
と 助詞,格助詞,一般,*,*,*,と,ト,ト O
* 28 32D 1/2 0.460756
置換 名詞,サ変接続,*,*,*,*,置換,チカン,チカン O
し 動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ O
て 助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 29 32D 0/1 1.011573
そこ 名詞,代名詞,一般,*,*,*,そこ,ソコ,ソコ O
に 助詞,格助詞,一般,*,*,*,に,ニ,ニ O
* 30 31D 0/1 1.154547
不溶性 名詞,一般,*,*,*,*,不溶性,フヨウセイ,フヨーセイ O
の 助詞,連体化,*,*,*,*,の,ノ,ノ O
* 31 32D 2/3 1.023025
亜鉛 名詞,一般,*,*,*,*,亜鉛,アエン,アエン O
化合 名詞,サ変接続,*,*,*,*,化合,カゴウ,カゴー O
物 名詞,接尾,一般,*,*,*,物,ブツ,ブツ O
として 助詞,格助詞,連語,*,*,*,として,トシテ,トシテ O
* 32 34D 1/1 0.066189
沈着 名詞,サ変接続,*,*,*,*,沈着,チンチャク,チンチャク O
し 動詞,自立,*,*,サ変・スル,連用形,する,シ,シ O
， 記号,読点,*,*,*,*,，,，,， O
* 33 34D 1/2 0.030409
象牙 名詞,一般,*,*,*,*,象牙,ゾウゲ,ゾーゲ O
細管 名詞,一般,*,*,*,*,細管,サイカン,サイカン O
を 助詞,格助詞,一般,*,*,*,を,ヲ,ヲ O
* 34 35D 0/0 0.000000
填 動詞,自立,*,*,五段・ラ行,体言接続特殊２,填る,ハマ,ハマ O
* 35 -1D 1/1 0.000000
塞 名詞,一般,*,*,*,*,* O
する 動詞,自立,*,*,サ変・スル,基本形,する,スル,スル O
EOS
***リンク [#hd6a5240]
-[[日本医薬品情報学会>http://www.jasdi.jp/]]~
[[論文誌を発行し始めたばかり:http://www.jstage.jst.go.jp/browse/jjdi/-char/ja]]
-[[東大 澤田康文:]]
-[[東大 澤田康文（寄附講座？）:http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~druginfo/]] ＜「医薬品ライフタイムマネジメント（Drug Lifetime Management、DLM）」を遂行するための「医薬品情報学（Drug Informatics）」の学問体系の確立≫ ということで、少し方向が違うかな？
-[[慶應 望月眞弓:http://www.pha.keio.ac.jp/laboratory/laboratory23.html]]
-[[千葉大 上田志朗:http://www.p.chiba-u.ac.jp/lab/jyoho/index_japanese.html]]
-[[昭和 加藤裕久:http://www10.showa-u.ac.jp/~pharm/labo/labo20.html]]
![[Toho University]](image/CLogo_Kihon_process.jpg "[Toho University]")
![[YYLAB]](image/yamanouc2.png "[YYLAB]")
